遗迹馆呈半圆形，建筑面积7588平方米，高度19米，跨度63米。舒展平缓的弧形外观与室外清新纯净的景观环境逐渐过渡、融合，形成了连续的空间变化。馆内无立柱大空间的构造保证了祭祀遗迹的完整性，大跨度钢结构形式将建筑对文物本体的影响降到最低，可持续的建筑设计把文物保护与生态保护相结合，为考古发掘和文物保护工作创造了良好的条件。

遗迹馆内是金沙遗址大型祭祀场所的发掘地，也是目前中国保存最为完整的商周时期的大型祭祀遗迹场所。原生态展示的发掘现场、大型树根遗迹等既保持了历史遗存本体的完整性与真实性，也为刚刚走进金沙遗址的观众带来了视觉上的震撼。在这里，观众一方面可以实地感受3000年前古蜀王国祭祀活动的宏大气派，另一方面又能身临其境，近距离观看考古发掘现场，了解考古发掘的工作原理。